可以说，这部影片的大部分场景，都是搭建的。
比如说锡安的洞穴大厅，比如说那個无数个门，比如说那个古典的两边有楼梯的大厅，比如一百多个史阎罗围攻吴龙的地方。
而最让人惊叹的是,这部影片里最精彩，也是最重要的场景，高速公路上的汽车追逐戏以及打斗，也是在拍摄场里进行的。
原版为了拍摄这场戏，自己搭建了一个2.5公里长的高速公路，这恐怖是全球最大的一个拍摄场地。
这个剧情拍摄用到的车辆,有三百多辆。
就崔妮蒂驾驶的那辆车，因为随着故事的发展,汽车被枪击被破坏,会有不同程度的变化。为此，特别准备了二十多辆车，弄成不同时间段的损坏程度，供拍摄使用。
吴龙拍这场戏，也是按原版那样修建这样一条高速公路。
因为高速公路这场戏，是电影汽车追逐戏中很精彩的一场戏。拍摄难度大，拍摄周期长，预估要两个半月到三个月左右的时间。
没有谁会为了拍一部电影，封闭那么长的高速公路，还封闭那么长的时间。
为了拍摄，只能自己建一条简易的高速公路供拍摄使用。
《黑客帝国2》的开头，和第一部一样，也是先由崔妮出场。
这一场打斗，她拿了个摩托车头盔，与拿警棍的保安对战。所有动作都由赵俪影亲自完成，没有用替身。
最后那招伏身，脚后撩向上，如同蝎子尾巴一样往前踢保安的头。也是赵俪影自己亲自完成。
这是影片的第一场打斗,算是小场面。
影片的第二场打斗，也是小场面。吴龙来找先知，先知的守护者要与吴龙比试一场，以便确定吴龙不是特工假冒。
这位先知的守护者，由齐柯饰演。
齐柯的武功，自从跟随吴龙以来，得到吴龙不少指点。自己平常也勤加苦练，如今功夫不错。
这场比试，他和吴龙一样，都没有吊威亚。
两人从地面打到桌面。吴龙没有全部按原版的武打设计，因为原版的武打设计招式太花。看起来有点舞术的感觉，而非武术。
特别是原版饰演尼奥的主演没有练过武，只是拍电影前集训几个月。他的动作打起来没有力量感，节奏也不够快，不够好看。
吴龙给齐柯设计的动作，融合有南拳、壁挂、通背和腿法。一阵猛攻，把处于守式的吴龙逼得跳上桌面。
从一张桌子打到另一张桌子，再打到第三张桌子。
第一张桌子上,吴龙后仰躲过齐柯的扫拳,齐柯却又接一个后旋踢,吴龙被迫再次后仰并下腰，躲开齐柯的后旋踢。几招过后，齐柯跳起飞踢，把吴龙逼到第二张桌子。
第二张桌子，两人比腿法。吴龙设计的腿法，没有原版那么花招。一踢一扫，不管是吴龙还是齐柯，都有很强烈的力量感和动作感。
腿法过后，吴龙一掌打得齐柯后空翻，落在第三张桌子上。吴龙跳起空中踢向齐柯，被齐柯化解。
最终，吴龙被齐柯双掌推出，倒飞撞在墙上。吴龙却借墙反弹，空中踢向齐柯，把齐柯逼回第二张桌子上。
这一段打斗很精彩。没有慢镜头，没有剪辑，是一个一分多钟的长镜头打斗。
接下来的打戏，是仅次于高速公路重头戏的精彩打斗。
在这里，吴龙与先知见面。
这个场景，是一个四面都是高楼的空地。和原版一样，没有找实地外景拍，而是在摄影棚搭建了整个场景。
因为这个场景的戏份很多，也很麻烦。只有在摄影棚里，才好使用固定光源。也只有在摄影棚里搭建的景物，可以方便的输入电脑中，形成3D虚拟场景。
这里的打斗，有点与《功夫》里主角打斧头帮众人的那段相似。而在吴龙前世的世界里，先有《黑客帝国》，再有《功夫》。两部影片的武术指导，都是同一个人，全球著名的武术指导袁八爷。
《黑客帝国2》里，吴龙不是和很多人打，而是和很多个特工史阎罗打。如此一来，拍摄就显得麻烦了。
首先，要找多个武行的人，样子和吴旌相似，个头差不多的，化妆成吴旌的样子。
原版就是这样。很多人以为，除了一个真人，其他都是3D虚拟人。其实不是，都是通过化妆，变成多个史密斯的样子。
本来吴龙想用长镜头的。就是因为打的都是史阎罗，这个长镜头用不了。
原版的拍摄，虽然用了多个相似的人。但通常正面有史密斯的镜头，都是真的史密斯饰演者与吴龙对打。
这样，就避免了穿帮。毕竟再怎么化妆，也是有差别的，不可能做到完全一模一样。
史阎罗的数量很多。先是七个八个史阎罗，接下来十几二十个史阎罗，打到最后在上百个史阎罗。
拍摄这样的场面，不可能化妆超过十人以上的史阎罗。其他的二十几个的时候，用武行代替，后期特效换头换脸。
等史阎罗召来更多的自己，那就是电脑特技了。
整场精彩的打斗，吴龙只有一些跳起来很高或很远的地方才吊威亚。其他武行一些被打的动作，要吊着威亚才能倒飞出想要的效果。
用到电脑特技制作3D虚拟人，就要使用动态捕捉，把真正的打斗场面捕捉下来。
包括吴龙，同样如此。
除了动态捕捉系统捕捉打斗动作，还有面部表情。那么多个史阎罗，他们的样子虽然一样，但面部表情各有不同。
另外，吴龙的风衣，也需要电脑特效员仔细研究衣服的质地、重量，在空中、不同动作下的形态。还有扣子等细节，都要和真实的一样。
吴龙这边在拍《黑客帝国2》，文之仁和沃纳那边拿着吴龙的营销计划，当圣书一样执行。
文之仁招好演员，立即开始拍摄。对于剧本，他先是按吴龙给的拍。然后，又按自己的理解，改进了一些他认为的剧本的不足之处，又拍一遍。
他要在六万美刀的有限资金下，尽可能好的拍出一部好电影。
半个月时间，电影就拍摄完成。直到电影杀青，三位主演才知道，他们采访的小镇居民，并非真实的居民，而是导演暗中安排的人。
当然，晚上被摇帐篷的事，三位主演事后就知道了。原本文之仁的计划，是杀青后才告诉他们。可三位主演当时的害怕了，不敢再拍下去。