●■●隆庆二年，立为皇太子，时方六岁。性岐嶷，穆宗尝驰马宫中，谏曰：“陛下天下主，独骑而骋，宁无衔橛忧。”穆宗喜，下马劳之。陈皇后病居别宫，每晨随贵妃候起居。后闻履声辄喜，为强起。取经书问之，无不响答，贵妃亦喜。由是两宫益和。
■六年五月，穆宗崩。
六月乙卯朔，日有食之。甲子，即皇帝位。以明年为万历元年，诏赦天下。祀建文朝尽节诸臣于乡，有苗裔者恤录。庚午，罢高拱。丁丑，高仪卒。壬午，礼部尚书吕调阳兼文渊阁大学士，预机务。
秋七月丁亥，初通漕运于密云。庚寅，察京官。己亥，戒谕廷臣，诏曰：“近岁以来，士习浇漓，官方刓缺，诋老成为无用，矜便佞为有才。遂使朝廷威福之柄，徒为人臣报复之资。用是薄示惩戒，余皆曲贷。诸臣宜祓除前愆，共维新政。若溺于故习，背公徇私，获罪祖宗，朕不敢赦。”庚子，尊皇后曰仁圣皇太后，贵妃曰慈圣皇太后。
八月戊午，祀大社大稷。
九月甲午，葬庄皇帝于昭陵。
冬十月己未，侍郎王遴、吴百朋、汪道昆分阅边防。辛酉，停刑。
十一月乙未，河工成。
十二月辛酉，振榆林、延绥饥。甲戌，以大行未期，罢明年元夕灯火及宫中宴。
●■●万历元年春二月癸丑，御经筵。
三月丙申，诏内外官举将材。
夏四月乙丑，潮、惠贼平。庚午，旱，谕百官修省。
五月甲申，诏内外官慎刑狱。
六月壬申，振淮安水灾。
秋七月，河决徐州。
九月癸未，振荆州、承天及济南灾。丙戌，四川都掌蛮平。癸卯，停刑。
冬十一月庚辰，命诸司立程限文簿，以防稽缓。
十二月己未，振辽东饥。
是年，暹罗、琉球入贡。
■二年春正月甲午，召见朝觐廉能官于皇极门。
二月甲寅，振四川被寇诸县。
三月癸巳，赐孙继皋等进士及第、出身有差。
夏四月丙寅，诏内外官行久任之法。
五月辛丑，穆宗神主祔太庙。
八月己巳，振山西灾。庚午，振淮、扬、徐水灾。
冬十月甲寅，决囚。丁卯，视朝阅铨选。
闰十二月庚寅，诏罢明年元夕灯火。
是年，琉球入贡。
■三年春正月丁未，享太庙。
二月戊寅，祀大社大稷。辛巳，诏南京职务清简，官不必备。丙申，始命日讲官分直记注起居，纂缉章奏，临朝侍班。
夏四月己巳朔，日有食之，既。壬申，书谨天戒、任贤能、亲贤臣、远嬖佞、明赏罚、谨出入、慎起居、节饮食、收放心、存敬畏、纳忠言、节财用十二事于座右，以自警。
五月庚子，淮、扬大水，诏察二府有司，贪酷老疾者罢之。
六月戊辰，浙江海溢。戊寅，命抚、按官，有司贤否一体荐劾，不得偏重甲科。
是夏，苏、松、常、镇大水。
秋八月丙子，礼部侍郎张四维为礼部尚书兼东阁大学士，预机务。丁丑，河决高邮、砀山。戊子，免淮、扬、凤、徐被水田租。
冬十月丁卯，地再震，敕群臣修省。戊辰，停刑。
十一月乙巳，祀天于南郊。
十二月辛未，诏罢明年元夕灯火。
是年，安南、琉球、暹罗、土鲁番入贡。
■四年春正月丁巳，辽东巡按御史刘台以论张居正逮下狱，削籍。
夏五月戊申，祀地于北郊。
六月庚辰，复遣内臣督苏、杭织造。
秋七月丁酉，谕吏、户二部清吏治，蠲逋赋有差，明年漕粮折收十之三。壬寅，遣御史督修江、浙水利。甲辰，修泗州祖陵。辛亥，草湾河工成。
八月壬戌，释奠于先师孔子。是秋，河决崔镇。
冬十月乙亥，振徐州及丰、沛、睢宁、金乡、鱼台、单、曹七县水灾，蠲租有差。
是年，安南、琉球、乌斯藏、土鲁番、天方、撒马儿罕、鲁迷、哈密入贡。
■五年春正月己酉，诏凤阳、淮安力举营田。
二月乙丑，振广西饥。
三月乙巳，赐沈懋学等进士及第、出身有差。
夏五月癸巳，广东罗旁瑶平。
秋八月癸亥，河复决崔镇。闰月乙酉朔，日食，阴云不见。
九月己卯，起复张居正。
冬十月乙巳，以论张居正夺情，杖编修吴中行、检讨赵用贤、员外郎艾穆、主事沈思孝，罢黜谪戍有差。丁未，杖进士邹元标，戍边。
十一月癸丑，以星变考察百官。
是年，琉球入贡。
■六年春正月，筑决河堤。
二月戊戌，免兗、青、登、莱所属逋赋。庚子，立皇后王氏。
三月甲寅，礼部尚书马自强兼文渊阁大学士，吏部侍郎申时行兼东阁大学士，预机务。甲子，张居正葬父归。
夏四月乙未，免湖广、四川逋赋。丙午，诏户部岁增金花银二十万两。
六月乙未，张居正还京师。
秋七月乙卯，吕调阳致仕。丙子，诏江北诸府民，年十五以上无田者，官给牛一头、田五十亩开垦，三年后起科。
九月庚午，诏苏州诸府开垦荒田，六年后起科。辛未，停刑。
冬十月辛卯，马自强卒。
十一月辛酉，礼天于南郊。
是年，乌斯藏入贡。
■七年春正月戊辰，诏毁天下书院。
二月己丑，遣使分阅边防。
三月甲子，免淮、扬逋赋。
夏五月癸亥，祀地于北郊。
六月辛卯，核两畿、山东、陕西勋戚田赋。
秋七月壬子，振苏、松水灾，蠲税粮。戊午，京师地震。
是年，乌斯藏入贡。
■八年春二月辛未朔，日有食之。戊子，耕耤田。戊戌，河工成。
三月辛亥，奉两宫皇太后如天寿山谒陵，免所过田租。甲寅，还宫。丁卯，赐张懋修等进士及第、出身有差。
夏闰四月庚申，广西八寨贼平。
冬十月辛丑，汰内外冗官。乙巳，振苏、松、常、镇饥。