奏疏上呈後，魏忠賢害怕了，向韓火廣請求調解。韓火廣不答應，他便跑到朱由校面前哭訴，並辭掉東廠職務。而客氏從旁爲他解釋，王體乾等人也一起護着他。朱由校懵然不辨真相，便溫語安慰他，而在第二天打回楊漣的奏疏，痛加斥責。楊漣既被斥責，魏大中以及給事中陳良訓、許譽卿，撫寧侯朱國弼，南京兵部尚書陳道亨，侍郎嶽元聲等七十餘人，紛紛上奏魏忠賢的不法之事。葉向高和禮部尚書翁正春請將魏忠賢遣回私宅，以平息公衆的指責。朱由校不許。[8]
那時，魏忠賢很氣憤，想將異己者全部殺掉。顧秉謙便偷偷地把魏忠賢所忌恨的人記錄下來，交給他，讓他逐個將他們貶斥。王體乾又倡議用廷杖，威脅廷臣。不久，工部郎中萬火景上書指責魏忠賢，立即被杖死。魏忠賢又借御史林汝翥的事侮辱葉向高，葉向高因此辭職而去，而林汝翥也被杖打，廷臣都很恐懼。
一時間被罷斥的有吏部尚書趙南星、左都御史高攀龍、吏部侍郎陳於廷以及楊漣、左光斗、魏大中等前後數十人。其後又驅逐韓火廣和兵部侍郎李邦華。正直之士離開朝廷，就如搖動枯樹紛紛落下的葉子一樣。魏忠賢於是假傳聖旨用舊例轉科道官員。以朱童蒙、郭允厚爲太僕少卿，呂鵬雲、孫杰爲大理寺丞，恢復霍維華、郭興治爲給事中，徐景濂、賈繼春、楊維垣爲御史，而起用徐兆魁、王紹徽、喬應甲、徐紹吉、阮大鋮、陳爾翌、張養素、李應薦、李嵩、楊春懋等人作爲他的爪牙。
不久，又起用擬被遣戍的崔呈秀爲御史。崔呈秀於是編造《天鑑錄》、《同志錄》等，王紹徽也編造《點將錄》，都以鄒元標、顧憲成、葉向高、劉一火景等爲魁首，並將不依附於魏忠賢的人全部網羅進去，將他們指爲東林黨人，獻給魏忠賢，魏忠賢很高興，於是這幫小人更加向魏忠賢獻媚，連手攻擊東林黨。[9]
當初，朝臣爭論三案以及辛亥、癸亥這兩年的京察和熊廷弼一案，魏忠賢本沒有參預。其黨徒想憑藉魏忠賢的權力排擠那些正直之士，便相繼歸附魏忠賢，自稱義子，並且說：“東林黨將要害您老人家。”因此，魏忠賢也想自圖快意。御史張訥、倪文煥，給事中李魯生，工部主事曹欽程等，競相打擊報復好人，而御史梁夢環又重興汪文言一案，將他下到鎮撫司拷打至死。許顯純編錄囚犯供辭的文書，詞語連及趙南星、楊漣等二十餘人，使他們或被撤職或被遣戍。又逮捕楊漣、左光斗、魏大中、周朝瑞、袁化中、顧大章等六人，將他們牽連進熊廷弼案中，投進監獄，拷打至死。又殺熊廷弼，將他的親家御史吳裕中杖打至死，又將尚書李宗延、張問達，侍郎公鼐等五十餘人撤職逐出，朝中機構爲之一空。而特召亓詩教、劉述祖等人爲御史。凡是與魏忠賢有私人關係都得越級升遷，於是魏忠賢的黨羽遍佈朝野。[10]
那時候，東廠的緝捕人員四出橫行，凡他們緝訪過的地方，不管情況是虛是實，都被整得稀爛。外戚李承恩，是寧安大長公主的兒子，家中藏有公主賜給的器物，魏忠賢誣告他盜竊乘輿服飾等禁物，將他判了死罪。中書吳懷賢讀楊漣的奏疏時，擊掌讚歎，家奴將他告發，結果懷賢被殺死，家也被抄了。武弁蔣應陽爲熊廷弼訟冤，立即被誅死。民間偶有言語觸犯了魏忠賢，便被捉拿殺戮，甚至被剝皮、割舌，被殺者不可勝數，人們路上相遇，只能以目傳意，不敢言語。這年，記門功，魏忠賢得加恩三等，庇廕都督同知。又蔭封他的族叔魏志德爲都督僉事。升傅應星爲左都督，並表彰他的母親，而以魏良卿爲僉書錦衣衛，掌南鎮撫司事務。[11]
魏忠賢
天啓六年（1626年）二月，皇帝儀仗隊組成，魏忠賢得以庇廕都督僉事，他又派黨羽李永貞假冒浙江大盜李實上奏，逮捕懲治前應天巡撫周起元以及已辭官歸鄉的江浙籍人高攀龍、周宗建、繆昌期、周順昌、黃遵素、李應升等。高攀龍投水而死，周順昌等人死於獄中。蘇州百姓見周順昌被捕，很不平，便打死了兩名校尉，巡撫毛一鷺便逮捕顏佩韋等五人，將他們誅死。刑部尚書徐兆魁治理獄案，凡是魏忠賢所恨的人，便判以重刑。魏忠賢又聽從霍維華的意見，命顧秉謙等人編修《三朝要典》，竭力毀謗東林黨人。御史徐復陽請拆毀講學書院，以絕黨根。御史盧承欽又請立東林黨碑。海內人士都屏息喪氣。霍維華於是教魏忠賢在邊防冒進邀功。[12]
遼陽男子武長春逛妓家，說了些妄言，被東廠擒拿。許顯純將他拷打治罪，故意誇大其辭說：“長春是敵人間諜，如不擒獲將有變亂，賴東廠臣屬忠誠機智，立下奇功。”朱由校詔封魏忠賢的侄兒良卿爲肅寧伯，賜給宅第、莊田，頒給鐵券。吏部尚書王紹徽請尊崇他的先世，朱由校詔令贈魏忠賢以上四世爲肅寧伯。魏忠賢又假傳聖旨派他的黨羽太監劉應坤、陶文、紀用鎮守山海關，收攬兵權。再給他記功，庇廕都督同知和世襲錦衣衛指揮使各一人。浙江巡撫潘汝楨奏請爲魏忠賢建祠堂。倉場總督薛貞說草場失火，賴魏忠賢救助，得以無害。於是爲他歌功頌德的人相繼不斷，各地祠堂都從此開始興建。[13]