宇宙天邊無際，而在廣闊的宇宙之中有一種東西維繫着宇宙運行的規則，人們稱之爲法則。
偉大的宇宙蘊育了無數已知的未知的生命、物種，而其中有一種最強大的種族，稱之爲——神魔。
神魔種族中神爲女性，魔爲男性，他們天生靈魂強大，擁有幾乎無盡的悠久生命，身體強悍，力大無窮且堅不可摧，反應力敏捷度跳躍力等等凌駕於一切物種之上，而最可怕的是，他們能領悟控制法則，他們將這種力量稱之爲奧義。
根據對宇宙法則理解深度的不同，他們將奧義劃分爲五個層次。不同的法則產生不同的奧義，而不同的奧義更各層次也不相同，但它們都有一個共同點。當對一種奧義領悟到第三層次，將得到宇宙認可，神魔們將奧義第三層次統稱爲‘位面’。
宇宙冥冥之中有一個地方記錄着生物的行爲與思考，神魔將之稱爲暗（次生物）位面，當奧義到達第三層次，受宇宙認可，意識可以進入暗位面，收集或抹去信息，同時汲取一定量暗能量（即次生物能量）。
神魔以血脈傳承奧義，血統高貴的純血神魔在成年後便會達到奧義第三層次，可以閱讀或抹去暗位面中的信息，同時身體重組成爲不死之體，只要有能量便能維持身體存活，而也只有到了這一層次才能真正稱爲神魔。
當奧義發展到第三層次（神）的極限，將會有毀滅一個小星球的力量，而第四層（神王）次會有毀滅幾個星球或小星系（如太陽系）的能力，至於第五層次（主神）將有毀滅一個大星系如銀河系的能力。
於是擁有毀天滅地的力量便神魔即便數量稀少依舊受到數目龐大的主流生物人類的信仰，憑藉着大量人力，神魔走上了巔峯，誕生了十二位第五層次的主神。他們的奧義分別是力量，時空，光明，黑暗，大地，天空，海洋，生命，死亡，雷電，火焰，寒冰。其中力量，時空，光明，黑暗，四位最強。
（注：力之奧義層次：力量精準，力場控制，位面，力量吸引，力量崩滅。
空間奧義層次：空間儲存，空間搬運，位面，空間之刃，空間湮滅。
時間奧義層次：時間瀏覽〈讓人看到某地點過去發生的事，神可以抹去痕跡〉，時間流速，位面，時間停滯，時間流轉。
黑暗奧義，層次：暗能，暗域，位面，黑洞，黑暗世界。組成法則：暗之法則，空間法則，吞噬法則。
光明奧義，層次：光能，光域，位面，白洞，光明國度。組成法則：光之法則，時間法則，聚變法則。
其他八種層次省略，書中詳敘。
奧義法則組成
天空：風，水法則
大地：金，土法則
海洋：水，聚變法則
生命：生命法則
死亡：死亡法則
雷電：光，熱，雷，音法則
火焰：光，熱法則
寒冰：水，冰法則）
當然，人類作爲主流生物之一，在漫長的演變之中也產生了自己的東西，如魔法（書中詳述），法力（風之法則），劍道（層次：劍氣，劍意，劍體〈位面〉，劍心，劍之世界）槍道（以劍道類推〉。但這些，在神魔的輝煌前都不值一提。
然而事實也是這樣，十二系奧義主神發現了最終恐懼的存在，無力抵抗，一致認爲應有奧義第六層次存在，他們命名爲——至高神。於是，十二系主神傾盡神魔種族的力量，以漫長的時間蘊育出了集合十二系奧義的到高神魔——十二翼惡魔天使與一種抵抗最終恐懼的力量。
然而，計劃到達尾聲，十二系主神卻莫名消失無蹤。更重要的是，與此同時，在浩瀚無垠的宇宙當中，人類種族誕生了一個凌駕於現所有已知文明之上的地方——神河星系，而拉開序幕的是生活在這裏的一位發明家，他的名字叫做丁格黑。
丁格黑致力於對未知世界的探索，對於所在星際之外那個無窮無盡的黑色世界，他一次又一次從心底泛起陣陣的無力感，如果自己沒有上萬甚至百萬千萬的壽命，能探索到的成果基本是微乎其微，所以他做出了一次科學領域上的探索轉折——基因工程，目的是創造出能夠生活萬年，百萬年甚至上千萬年的人種，可能只能創造出極少數，但也只有這樣的人才能夠有足夠的時間和精力去探索宇宙。
於是他提出“超神基因工程”理念，併成功的解析了一些神魔血脈，造就了一位第五層次的存在——“時光神”基蘭，基蘭擁有不同於十二奧義的由時間法則，光之法則組成的時光奧義，並深度達到逆轉時光的第五層次，時光神的誕生最偶然性，丁格黑終其一生也沒有再製造出第五層次，甚至於第四，三層次的存在，於是他轉而開始研究武器，並創造了大時鐘。
但即便如此，在力量的誘惑下，神河星系爲首，以掠奪神魔血脈爲目的，弒神戰爭悍然發動。
在戰爭中，低血統神不甚重負，而凱沙女王也應運而生，凱沙創造神聖奧義（光之法則，時間法則，生命法則組成）並達到第四層次，將科技與奧義組合，在一些神體內植入暗植計算機，用自身基因爲模板改造基因神體，稱爲天使，使還沒有達到第三層次的高階天使便可意識進入暗位面，汲取次生物能量，還保留了神盡乎無盡的生命。很快天使文明成爲與神河文明同一級別的星雲，同時退出戰爭。
神魔種族由於最高戰力消失，天使的退出戰爭，而神河星系有時光神，戰爭失敗，但神魔底縕深厚，憑藉長時間對最終恐懼的瞭解在最後一次戰役中引動最終恐懼與神河文明同歸於盡，只有丁格黑與基蘭活着離開。
作爲丁格黑畢生最偉大發明的基蘭，星際的毀滅讓他領悟到，無論文明如何的高度發展，都避免不了這種被湮滅的命運。丁格黑死後，基蘭開始踏上了宇宙旅行。
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bsp; 在遊歷宇宙的時候，基蘭選擇性的在其他高等級文明星球上建立據點——“超神學院”。試圖通過這個載體，把神河文明的先進技術和道德理念，以及之前那種體會到的星際文明湮滅恐懼感和防範帶給相對年輕的世界。其中，就有“超神基因工程”一些最重要的科技理念，比如微型蟲洞搬運技術，宇宙中暗能量和暗物質揭祕技術。當然，建立“超神學院”的先決條件是，這個高等級文明上除了有初步的進化和科技知識，還要經歷過核洗禮。