不用說，這幾本妖書自然是郭致遠提前安排張承藏在皦生光家的，但陳矩不知道啊，立刻如獲至寶，拿了妖書回來向萬曆覆命，詳細地把搜查經過和結果說了一遍，把妖書也呈了上去，沉聲道：“萬歲，據臣調查得知，這皦生光雖爲順天府生員，平日卻專以“刊刻打詐”爲生，據其平日之行爲及搜查所得之物證，這皦生光應爲妖書案元兇無疑，可惜老臣率人趕到之時，那皦生光已舉家畏罪潛逃，老臣已命令東廠所部傾巢出動，繼續追捕此人”。
聽完陳矩的敘述，那些朝廷大臣都面面相覷，或驚愕，或懷疑，表情十分豐富，沈一貫先是一驚，眼中閃過一道寒光，立刻站出來大聲道：“啓奏聖上，妖書一案事關國本，茲事體大，以占卜之結果下結論太過兒戲，且妖書中多處提及宮闈及朝庭祕事，論述深刻，非熟悉朝廷之大臣不能爲，這皦生光不過一介生員，有何能耐著妖書依老臣看，分明是郭致遠故弄玄虛，故布謎局，意圖矇蔽聖上，足見其居心叵測，老臣懇請聖上立刻下旨將這狡詐之徒拿下，交於老臣嚴加審訊，必能找到妖書案之線索”。
郭致遠見沈一貫仍不死心，也冷笑一聲道：“沈相莫非忘了，適才讓小子以占卜之術尋找妖書案元兇的是你，如今元兇已找到，說太過兒戲的又是你。聖上聖明，自有聖斷，又豈是小子能矇蔽得了的倒是沈相你反覆無常，死咬這妖書案不放，不知又是何居心啊”。
“你”沈一貫氣得滿臉脹成了豬肝色，差點吐血，事到如今，他如何不知道自己又被這滑頭小子擺了一道，奈何棋失一招，已掉進郭致遠事先挖好的坑裏，再要反駁也是有力使不出了。
萬曆臉上陰晴不定，目光閃爍不停，他自然也發現皦生光涉案的諸多疑點，就有些猶豫不決，郭致遠見狀，連忙繼續道：“聖上，妖書案涉及國本之爭，然太子之位早定，只要聖上謹遵祖宗法度，妖言不攻自破，又何爭之有呢”。
郭致遠這話就說得十分大膽了，等於在批評萬曆，正是由於他在太子之位這個問題上搖擺不定，有廢長立幼的想法，纔會有妖書的出現，此言一出，不僅在場衆人驚愕萬分，萬曆眼中也閃過一道寒光，一股有若實質的殺機朝郭致遠籠罩而來。
天子一怒，伏屍百萬，這皇帝發火可不是好玩的，至少郭致遠的小命是不夠他殺的，郭致遠也感覺背心裏冷汗直流，雙腿發軟，但事情發展到這一步，郭致遠也只能賭命了，畢竟歷史上萬曆最終沒有廢長立幼，說明他還是有所顧忌的。
這一番話說完，郭致遠彷彿把全身的力氣都用完了，對他來說，該做的都做了，該說的都說了，老天爺既然讓自己穿越過來，應該不會讓自己這麼短命吧，所以此時的他倒是完全放鬆下來了，目光平靜地望着眼中寒光閃爍的萬曆，顯得很是淡定。
此時殿內的空氣彷彿凝滯了，時間也彷彿凝滯了，所有人的目光都集中在萬曆身上，看他如何決斷。後世對萬曆的評價多是說他昏庸懶政，十幾年不上朝，但其實世人都小看了萬曆，作爲明朝在位時間最長的皇帝，若真是個糊塗蟲，只怕早把自己給玩死了，又怎麼可能統治那麼長時間呢
所以萬曆絕不糊塗，相反他比誰都聰明，他十幾年不上朝，卻對朝中大臣瞭如指掌，對大臣們的爭鬥洞若觀火。此時他臉上陰晴不定，誰也看不透他的心思，也不知過了多久，萬曆突然展顏一笑，用手指點了點郭致遠道：“敢如此與朕說話的，你是第一人，你所言雖有些大逆不道，但勇氣可嘉朕恕你無罪”。
說着又對身後的太監道：“傳旨，妖書一案既已真相大白，當昭告天下，以正視聽，今後若再有妄議者，以叛逆罪論處，誅九族着東廠繼續緝捕元兇皦生光，將其早日緝拿歸案，不可懈怠一干涉案人犯，若查無實據，皆無罪開釋，禮部侍郎郭正域正直敢言，教子有方，可擔大任，着內閣諸大臣議處”。
沈一貫一聽就急了，這樣一來他的如意算盤就全落空了，而東林黨勢必會東山再起，成爲他的心腹大患，連忙站出來道：“聖上，萬萬不可妖書一案尚有諸多疑點，豈可草草結案，請聖上三思啊”。
萬曆眼中閃過一道寒光，不等沈一貫把話說完，就用力一揮手厲聲道：“朕意已決，勿需再議沈愛卿近來過於操勞，身體欠佳，可在家休養些時日，內閣事務就由沈閣老暫代爲主持吧”。
見萬曆真火了，沈一貫也不敢再說什麼了，萬曆都讓他回家養病了，再不識趣，沒準真讓他告老還鄉，那就真完蛋了
傳旨完畢，萬曆又轉過頭來，眯着眼睛望着郭致遠似笑非笑道：“朕有言在先，若你果能找到妖書案元兇，朕定重重有賞，你想要何賞賜啊”。