此時，劉秀掃蕩北方亂兵的工作基本宣告結束。放眼望去，整個廣闊的北方都是劉秀的地盤了。這時有人告訴劉秀：時機成熟，可以稱帝了
首先以文書提出來的，正是馮異和寇恂。此信傳開後，將領們紛紛請求。馬武道“如今天下無主。大王雖執謙退，難道不顧宗廟社稷嗎如今應先回到薊縣舉行登基大典，然後可議征伐。否則我們究竟認誰是主誰是賊呢”劉秀急忙道“將軍休得妄言。可斬也”
隨後劉秀收兵回到廣陽郡薊縣。命吳漢率耿弇、景丹等十三將軍追擊尤來亂軍，斬首13千餘級，一路追殺至右北平郡的浚靡縣而還。尤來殘部散入遼西、遼東等郡，爲烏桓、貊人所鈔擊，殺掠殆盡。
賈復則追擊五校亂軍至真定國。在與對手的戰鬥中，賈復身受重傷。劉秀得報後大驚“賈復勇敢絕倫。我以前從來沒讓他自統一軍，正是怕他輕敵。若真的不幸，豈不喪我一員名將現在聽說賈復的妻子有孕在身，若生的是女兒，將來就是我的媳婦；若生男孩，我的女兒就嫁給他。絕不讓賈復有身後遺憾”此話傳入賈復耳中，賈復感激異常，隨即病癒。回到薊城得與劉秀相見，彼此甚歡。
劉秀部隊繼續南還，經過涿郡范陽縣時，劉秀命令收葬吏士。到了中山國，諸將又勸劉秀登基，劉秀仍不聽。部隊繼續南下至常山郡平棘縣，諸將再勸劉秀登基，劉秀說“如今寇賊未平，四面皆敵，怎能急着稱尊呢大家都退下吧”諸將都退出，只有耿純留下來，又說了一番大道理“天下的士大夫們，捐親戚，棄鄉土，來歸大王。甘冒矢石，無非就是想攀龍附鳳，博取功名。若大王一再違反衆意，不肯正位，只怕士大夫們望絕計窮之後，盡有去志。大衆一散，便不能複合了”這番話說的劉秀沉吟半晌，最後說了一句“讓我再想想吧”
稍有點古代歷史政治常識的人都知道：這叫作秀。古之稱帝者，必有三辭。當然劉秀也不完全是作秀。當初漢高祖劉邦稱帝，是在垓下之戰滅了項羽之後。今天這個情況可不同，長安城劉玄還在跟樊崇火拼、洛陽城還關着朱鮪那隻那困獸。也就是說：天下未平，只小半在手，此時稱帝到底合不合時機這纔是劉秀最顧慮的
要回答這個問題，估計馮異最爲合適。自從劉秀當上大司馬後，馮異就在幕後策劃劉秀自立。今天，他終於可展示推手的重磅威力了劉秀部隊到達鄗縣後，他就下令把馮異召來。馮異以無比堅定的語氣告訴劉秀“劉玄肯定是要滅亡的。到時天下無主，必須更加混亂。所以我強烈建議：爲了社稷百姓，請大王您答應衆將之請，登基稱帝”
馮異一番話猶如貫虹長劍，直入劉秀心靈深處。這時，劉秀當年遊學長安時，一個叫強華的同學千里迢迢地從關中給他帶來一樣神祕武器，堅定了劉秀的信心
這個神祕武器其實並不神祕。劉秀多年前在新野販谷時就見過：神祕預言書，或稱圖讖
強華帶來的是一本叫赤伏符的圖讖，上面有三句話“劉秀髮兵捕不道，四夷雲集龍鬥野，四七之際火爲主”
四七二十八。從漢高祖劉邦稱帝到今年，正好228年，恰好應驗了“四七”而西漢王朝從漢武帝時期開始便定爲火德。這正是劉秀建立王朝、中興大漢的天命所歸
劉秀再也沒理由拒絕了他讓有司在鄗縣之南的千秋亭五成陌築壇。6月22日，劉秀正式登基稱帝，大赦，定年號建武。一個嶄新的王朝，正式拉開序幕
鄧禹攻打河東郡治安邑縣，數月未下。劉玄手下的大將軍樊參率數萬人在河東、弘農二郡交界的大陽縣渡過黃河，想攻擊鄧禹。卻在解縣之南被鄧禹反擊，戰死。25日，王匡、成丹、劉均等人合兵十餘萬，與鄧禹大戰取勝。26日是六甲窮日，不利出戰，鄧禹抓緊時間重新整合部隊。27日，兩軍再度交戰。鄧禹大勝。劉均及河東郡太守楊寶被殺，河東郡陷落。王匡等人逃回長安。
劉玄等人進入長安城後，猶如鄉下人進大城市。見到這麼大場面，一下子都適應不過來。朝議時，文武百官都來開會。劉玄坐在殿上不知說些什麼好，只好不停地摳着手指甲。突然他發現自己要說點什麼了，就問了一句“請問諸位，今天搶了多少東西”劉玄此話一出，當場就雷倒了衆人。過去是搶匪，沒想到當了皇帝，還把自己當搶匪。
可認真想想，角色的轉變，也不是劉玄本人的錯。進城後沒人對他進行過專門訓練，對於朝會儀式，他哪懂什麼呢
於是王匡在前線敗歸後，長安城內的綠林軍們個個都開始準備後路了。首先是一個叫張卬的下江兵將領建議“赤眉軍就要殺進來了，河東郡還有鄧禹的軍隊在虎視眈眈。咱想保長安是沒指望了，不如大搶
一把，回南陽郡去。大不了就再入湖池中爲盜嘛”
這一建議馬上就得到了衆將領的一致擁護。於是他們集體來見劉玄。沒想到劉玄一聽，臉就黑了。大難當頭，不想着抵抗，就想搶一把走人實在是滅自己威風衆將看劉玄已氣得一句話都說不出來，便只好退下。
接着，劉玄命王匡、陳牧、成丹、趙萌等率兵出屯新豐縣。李松移軍掫城，以拒赤眉。嚴令他們：無論如何，也不能就這樣把長安城拱手相讓
新市兵首領王匡、平林兵首領陳牧、岳父趙萌等人盡皆領命。可之前就想搶一把走人的那幫將領卻不聽使喚了。張卬、廖湛、胡殷、申屠建、隗囂等人決定：趁立秋大祭之機，劫持劉玄走人
可陰謀竟然泄漏了劉玄決定將計就計。他聲稱有病，請諸將入宮議事。劉玄是這樣想的：只要他們一到宮裏，來一個殺一個、來兩個殺一雙
諸將皆奉命入宮，只有隗囂也稱病不往，並與門客王遵、周宗等人勒兵自守。這一下，劉玄猶豫了。張卬、廖湛、胡殷一看情形不對，拔劍突圍，闖出宮去。只有申屠建被劉玄所殺。
劉玄再派親信鄧曄率兵攻打隗囂的府第。隗囂突圍，奔回天水郡。張卬、廖湛、胡殷則起兵攻打劉玄。
劉玄大敗，走投無路之下，第二天清晨逃出長安城，到新豐縣投奔了岳父趙萌。劉玄和趙萌商議認爲：這些將領造反，如沒王匡、陳牧等人支持，是不可能興風作浪的所以擒賊先擒王，一定要先搞定王匡和陳牧